某日，小新未来的新娘多美子从20XX年的未来都市“Neo Tokio”来到小新的面前。多美子告诉小新，未来的他被“Neo Tokio”的支配者也就是多美子的父亲金有增藏给绑架了，需要只有5岁的小新帮忙解救。于是小新决定和多美子乘坐时光机去未来都市。　　到达未来的他们立刻开始寻找已经成年的小新，可是却遭到了金有增藏派出的刺客袭击。小新能否成功救出未来的自己呢？他能顺利和多美子喜结良缘吗？“Neo Tokio”能重夺光明美好未来吗？小新的自我拯救行动就要开始了！

小新与朋友们在公园玩耍，一名神秘女子，自称是小新未来的新娘，因为受到长大后的小新所托付，要带小新到未来去。风间等人觉得女子很可疑，为了救小新也跟到未来去。在未来，地球被巨大陨石群撞上，天空一片黑暗。长大后的小新，看到世界一片黑暗，决心要让世界变得更明亮，但只靠他一人的力量并不足够。于是，一场紧张刺激的冒险就此展开。

《蜡笔小新:超时空!呼风唤雨之我的新娘》:一个叫多美子的女子突然出现在小新面前，她自称是未来小新的新娘，坐着时间机器穿越时空来到这里。 原来，长大后的小新被未来都市"新东京"的支配者金有增藏抓住了，为了救他出来，需要五岁小新的相助。虽然多美子忧心忡忡、着急不已，但小新还是一付神在在的样子。气恼的多美子开始怀疑未来的他究竟是不是自己的未婚夫，而小新也不中意多美子，认为自己将来不可能娶她。 虽然有矛盾，但两人还是启程前往新东京。由于陨石撞击地球，天空布满尘沙，未来的世界没有阳光。小新、多美子以及卷入时电影下载空瓦普的风间、妮妮、正男、春日部防卫队一起四处寻找成年小新的下落。 不料，增藏派出了"新娘（志愿）军团"袭击他们。该军团由一群待嫁的未婚女性构成，她们不是披着婚纱就是穿着白无垢，增藏承诺谁抓住了小小新，他就为之安排结婚对象。面对带着强烈的婚活能量席卷而来的可怕军团，小新等...